これからEl CapitanにTeX Live 2015を入れようとしている人は、このページを読むよりも、OS X El Capitan に Homebrew を使って TeX Live 2015 をインストールする手順を読む方がいいかもしれません。
このページで書いたことは、以下のTeX Wikiに書かれたことを読んで結城が試した手順メモです。TeX Wikiを読むことをお勧めします。
また、TeX Live 2013 から TeX Live 2015 に tlmgr で update できるというのはバグ的仕様らしく、あまりお勧めできないとのことです。
https://twitter.com/aminophen/status/651156328895791104
実際には「今まで入っていたかどうかは一切気にせず、install-tlを走らせるか、portかbrewか、またはMacTeXやBasicTeXをGUIで入れるだけで大丈夫だったはず」とのこと。
https://twitter.com/aminophen/status/651160288364920837
以上をご理解の上、以下はあくまで結城がやったことの記録としてお読みください。
$ sudo tlmgr update --self --all
$ tlmgr info jfontmaps
package: jfontmaps
installed: Yes
...
cat-version: 20151002.0 # ←これが20151002以降であることを確認する。
$ platex --version
e-pTeX 3.14159265-p3.6-141210-2.6 (utf8.euc) (TeX Live 2015)
...
$ cd /usr/local/texlive/2013/texmf-dist/scripts/cjk-gs-integrate
$ sudo perl cjk-gs-integrate.pl --link-texmf --force
$ sudo mktexlsr
$ sudo updmap-sys --setoption kanjiEmbed hiragino-elcapitan-pron
$ vi sample.tex
$ cat sample.tex
\documentclass{jsarticle}
\begin{document}
これは\LaTeX2e{}のサンプルです。
\end{document}
$ platex sample
$ dvipdfmx sample
$ open sample.pdf